本處隸屬於臺北市政府勞動局，為本府二級機關，置處長、副處長、主任秘書各1人，下設7科4室，預算員額101人，組織架構圖如下：
處本部包含處長、副處長、主任秘書、秘書共4人。
本處各單位職掌(預算員額數)如下：
| 科室名稱(人數) | 職掌簡介 |
|---|---|
| 綜合規劃科(9人) | 勞動檢查與職業災害統計、勞動檢查資訊系統管理、教育訓練綜合事項、大眾傳播業安全衛生勞動監督檢查及其他支援勞動監督檢查等相關事項。 |
| 勞動條件科(12人) | 全行業勞動條件監督檢查相關事項。 |
| 土木工程科(8人) | 土木工程安全衛生勞動監督檢查及其他重大工程安全衛生勞動監督檢查等相關事項。 |
| 建築工程科(19人) | 建築與修繕工程安全衛生勞動監督檢查及營造綜合勞動檢查等相關事項。 |
| 職業衛生科(9人) | 物理性、化學性等特殊危害作業場所安全衛生之監督檢查與勞工作業環境之採樣及化驗等相關事項。 |
| 危險機械設備科(9人) | 危險性機械設備檢查與發證、代行檢查機構之指導及監督等相關事項。 |
| 一般行業科(13人) | 其他科主管以外類別安全衛生勞動監督檢查相關事項。 |
| 秘 書 室(13人) | 文書、檔案、出納、總務、財產之管理與法制、研考等業務及不屬於其他各單位事項。 |
| 會 計 室(2人) | 依法辦理歲計、會計及統計事項。 |
| 人 事 室(2人) | 依法辦理人事管理事項。 |
| 政 風 室(1人) | 依法辦理政風事項。 |
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